Startpagina / Samenvattingen / Human monogenetic diseases / mutatie-missense-aminozuur

Moleculaire pathologie - Missense mutaties

6 belangrijke vragen over Moleculaire pathologie - Missense mutaties

Noem wat kenmerken van missense mutaties

Er is een aminozuur substitutie
De meeste missense mutaties hebben geen effect
Het representeert normale genetische variatie
Soms hebben ze wel een pathogeen effect

Waar hangt het effect van een missense mutatie op een eiwit van af?

het type aminozuur substitutie
De verschillen tussen het normale aminozuur en de variant
De locatie van de affected aminozuur in het eiwit
Of de missense mutatie in het functionele domein zit

Een voorbeeld van een missense mutatie is bij sickle cell in het HBB gen. Wat is hier aan de hand?

Bij HBB is de normale aminozuur hydrofiel en bij de mutatie hydrofoob dus klonteren ze samen

Hoe kan je neutrale substituties onderscheiden van pathogene?

Dit doe je door te kijken naar hoe gelijk de aminozuren zijn. Aminozuren die veel op elkaar lijken en in elkaar veranderen bij een mutatie is het vaak dat het effect niet zo groot is. Als ze meer verschillen zal het effect groter en schadelijker zijn.

Wat is de Grantem score?

Granthem score is een nummer van 0-215 dat de biofysische verandering van de aminozuren weergeeft. Wanneer deze hoger is dan is de verandering groter en waarschijnlijk het effect dus ook (! Let op het hoeft niet altijd zo te zijn, het kan ook geen effect hebben). Hier is een tabel voor (zie afbeelding).

Waar moet je ook naar kijken bij missense mutaties om hun pathogeniciteit te bepalen?

De conservatie van het deel waar de mutatie in zit.

Sommige nucleotiden zijn meer geconserved dan de ander. Als deze dan een mutatie heeft kan je denken dat dit een groter effect heeft, want waarschijnlijk is hij belangrijk als hij zolang bewaard blijft.

Hetzelfde geldt voor aminozuren die ook meer of minder conserved kunnen zijn.