Dit zijn flashcards en notities die gemaakt zijn door studenten over onderwerpen als 'lipiden', 'nanodiscs' en 'sma', komende uit:

Studiemateriaal generieke omslagafbeelding
Vak
- Membraan & Membraaneiwitten
- Killian
- 2021 - 2022
- Universiteit Utrecht
- Molecular and Cellular Life Sciences
143 Flashcards en notities
  • Deze + 400k samenvattingen, ook in PDF!
  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers die je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo

Flashcards over lipiden, nanodiscs, sma

Waarom kan je beter membraaneiwitten onderzoeken in lipiden bilagen dan in micellen? Maar wat zijn nog steeds de nadelen hiervan?
1. Bilaag is een beter mimiek van het membraan dan de detergent (eiwit meer stabiel)
2. Laat ander soort type studies toe (e.g. transport)
3. Lipiden compositie kan worden gecontroleerd
4. Binnen en buitenomgeving kan worden gevarieerd
Nadelen: geen asymmetrie van eiwitten en lipiden, verschillende eigenschappen (compositie, dynamiek, curvature, etc....)
Rapporteer
Wat kan een alternatief modelsysteem zijn voor vesicles en wat voor soorten heb je hiervan?
Nanodiscs zijn kleine discs van membraan in een lipide bilaag: de disc is wateroplosbaar gemaakt door shielding van de hydrofobe acylketens met amfipatische moleculen. Hiervan heb je twee soorten: MSP (membrane scaffolding protein) en SMA (styrene maleic acid).
Rapporteer
Wat zijn MSPs en wat kun je er allemaal mee doen? Wat zijn de voor- en nadelen hiervan?
MSPs zijn amfipatische eiwitten in een alfa-helix die de acylketens van de nanodiscs beschermt
  1. Diameter kan worden gevarieerd door grootte van het eiwit te veranderen
  2. Tags kunnen worden toegevoegd voor zuivering of visualisatie
    • Nadelen:
      1. Risico van partiële denaturatie (door detergentia)
      2. Gedoe voor het vinden van een goede detergent
      3. Verlies van natieve interacties
    • Voordeel: mogelijk specifieke lipiden compositie
Rapporteer
Wat zijn SMAs? Wat voor eigenschappen hebben ze?

SMAs zijn gemaakt van een amfipatisch polymeer en gesynthetiseerd door radicaal reacties → veel verschillende lengtes. Samenstelling heterogeen in lengte en compositie → stabiliseert goed nanodiscs. Polymeer kan rechtstreeks membranen oplossen uit het natieve membraan en vormt dus meteen nanodiscs.
Rapporteer
Wat zijn de voordelen van nanodiscs en van vesicles?
Voordelen nanodiscs:

  • Met MSP kun je eiwitten taggen en aan SMA polymeer kun dingen chemisch koppelen
  • Klein: geschikt voor veel verschillende technieken voor karakterisatie
  • Aggregatie aantal van de eiwitten kan worden gecontroleerd
  • Toegang tot het eiwit van beide kanten van de bilaag


Voordelen vesicles:
  • Gesloten systeem geschikt voor transport studies
  • De grootte van de vesicles en dus de membraan curvatuur kan worden gevarieerd
  • Eiwit (complexen) met grote cross-sectional size kan worden incorporated
  • Processen die laterale diffusie bevatten kunnen worden bestudeerd (associatie en dissociatie)
Rapporteer
Hoe kan je SMA vorming monitoren? En wanneer vormen ze goed?

Gebruiken model membraan systemen om de efficiëntie te monitoren van nanodisc formatie bij turbidity assay: liposomen zijn niet helder en nanodiscs wel → dus naar de helderheid kijken.
  • Met EM zie je een vesicle-to-nanodisc transitie in 14:0-PC door toevoegen van polymeer
  • Functie van temperatuur bekijken → hogere temperatuur zorgt voor snellere solubilisatie van di-C14:0 bilagen → efficiënter oplossen bij smelttemperatuur overgang
Rapporteer
Wat zijn een aantal eigenschappen van SMA met betrekking tot de oplosbaarheid?
1. SMA kan makkelijk inserten
2. Lost alle PC lipiden efficiënt op bij T>- Tm
3. Oplosbaarheid van onverzadigde lipiden is minder efficiënt dan verzadigde lipiden bij T >- Tm
4. Geen voorkeur voor oplosbaarheid van lipiden in de vloeibare fase maar wel een voorkeur voor de vloeibare fase tov de gelfase
5. Raft-like domeinen lossen niet goed op
Rapporteer
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart