Door adhesins, die oppervlaktemoleculen van de gastheercel herkennen. Pathogenen kunnen echter ook koloniseren door hun eigen receptoreiwit te injecteren, of door een 'voetstuk' te creëren via fosforylatie van Tir.

Het zipper mechanisme werkt doordat een bacterie een adhesin presenteert die op eenr eceptor past die normaal gebruikt wordt voor cel-cel interacties of cel-matrix adhesie. Hierdoor maakt de gastheer contact.

Bij het trigger mechanisme stimuleren bacteriële effectors tot aanmaak van membran ruffles en de vorming van endocytotische vesicles.

Door  te ontsnappen, via bijvoorbeeld een porievormend eiwit die alleen actief is in het fagosoom.

Door fusie van het fago/endosoom met het lysosoom te voorkomen, via verandering van het endosoom of een ander gastheercelmembraan.

Door te overleven in het fagolysosoom.