Lees hier de samenvatting en de meest belangrijke oefenvragen van Principles of physical biochemistry | 9780130464279 | Kensal E. van Holde, W. Curtis Johnson, P. Shing Ho.

• 5 Methods for the Seperation and Characterization of Macromolecules

  Dit is een preview. Er zijn 19 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 5
  Laat hier meer flashcards zien

• Wat is het nut van een 2D gel?

  Een 2D gel kan een volledig proteoom (tot zo'n 1000 eiwitten) laten zien. Hierbij gebeurt de scheiding op één as op basis van het isoelektrisch punt en op de andere as op massa.

• Wat zijn de problemen bij proteomics?

  De capaciteit, sensitiviteit en het dynamisch bereik van de meetapparatuur.  Hierdoor zijn er veel eiwitten die wel vaak genoeg voorkomen om opgemerkt te worden, maar toch niet gedecteerd worden, omdat ze onderdrukt worden door eiwitten die heel veel voorkomen.

• Hoe kunnen alle eiwitten beter geïsoleerd worden voor analyse?

  Door reductie van de complexiteit van het eiwitmengsel. Door het organisme af te breken naar weefsel en celtype, of zelfs cel of subcellulaire fractie kunnen alle onderdelen geïsoleerd worden.

• Hoe werkt velocity differential centrifugation, en wat heeft het voor nut?

  Velocity centrifugation is gebaseerd op het feit dat er bij een bepaalde snelheid moleculen in het pellet terecht komen. Bij een hogere snelheid komen er kleinere moleculen in terecht en door het variËren van de snelheid waarmee oplosmiddel en molecuul worden gemixt variëert de dichtheid.  Bij deze centrifugatie kan de sedimentatiecoëfficient worden bepaald.

• Hoe werkt equilibrium density centrifugation, en wat heeft het voor nut?

  Bij equilibrium centrifugation wordt het molecuul op één plaats gehouden en onstaan er sedimenten in de buis met elk een bepaalde concentratie. Hierdoor kan de massa worden bepaald, vorm speelt geen enkele rol.

• Hoe wordt er bij analytische ultracentrifugatie u en r bepaald tijdens het sedimenteren?

  Tijdens het sedimenteren zijn de pellet en de oplossing zonder deeltjes te onderscheiden. De afstand tussen de pellet en het begin van de oplossing vanaf de as verandert in de tijd en geeft u. De positite van de pellet ten opzichte van de as geeft r.

• Wat is het sedimentatie evenwicht?

  Dat is de toestand waarin de terugvloei door diffuse gelijk is aan de wegvloei geproduceerd door sedimentatie in elke cel in de oplossing.

• Hoe worden moleculen die ongeveer dezelfde lading, maar een ander molecuulgewicht hebben gescheiden op gel?

  Op moleculaire grootte.

• Grote moleculen blijven soms steken in de poriën van lage-concentratie agarose gels, hoe kan dit worden opgelost?

  Door pulsed field elektrophoresis, waarbij er een periodieke, tijdelijke omkering of verandering van richting van het elektrisch veld is. Hierdoor kunnen de moleculen loslaten en weer verder.

• Wat voor invloed heeft de tertiaire structuur van DNA tijdens elektroforese?

  Compacte, kleine moleculen zullen sneller migreren dan grotere.