Lees hier de samenvatting en de meest belangrijke oefenvragen van Samenvatting

• 1 celcompartimenten deel 1

• 1.1 aminozuren en post trans modificaties

  Dit is een preview. Er zijn 1 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 1.1
  Laat hier meer flashcards zien

• Wat is een post translationele modificatie?

  Dit zijn modificaties nadat het aminozuur ingebouwd is in de keten van bestaande aminozuren.
  

  • post translationele modificaties kunnen alleen plaats vinden in de zijketens

• Op welke 3 aminozuren kan fosforilatie plaats vinden en waarom?

  • Serine 
    
  • threonine
  • tyrosine
  • omdat hier een vrije OH groep zit, waar fosfaat aan kan binden 

• Waar zorgt de invloed van de PH voor bij een aminozuur?

  De verandering van de PH kan zorgen voor een verschuiving in de lading van de aminozuur R groep. Dit heeft gevolgen voor de conformatie van een eiwit.

• Er zijn nog andere chemische modificaties van aminozuren noem er 3 en voor welke aminozuren dit geld?

  • Acetylering van histon lysine aminozuren zorgt voor minder positieve lading en dus minder interactie met DNA (lossere structuur)
    
  • hydroxylering van proline zorgt voor scherpere draaiing in polypeptide keten
  • carboxylgutamaat zorgt voor Ca2+ binding

• 1.2 vouwing; spontaan en m.b.v. chaperon eiwitten

  Dit is een preview. Er zijn 1 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 1.2
  Laat hier meer flashcards zien

• Welke 3 krachten zorgen voor de conformatie?

  • Sterische beperkingen 
    
  • van der waals krachten
  • niet-covalente bindingen
  • elektrostatische krachten 
  • waterstof bruggen
  • hydrofobe interacties
  • covalente bindingen 
  • zwavelbruggen tussen cysteines 

• Waar zorgt de vouwing van een eiwit voor?

  De vouwing van een eiwit zorgt er vooral voor dat de hydrofobe aminozuren zich afkeren van de buitenkant van het eiwit en dus naar de binnenkant gevouwen worden.
  

  • aminozuren met apolaire zijketens zijn hydrofoob en bevinden zich voornamelijk binnen in een eiwit 

• Waar bevinden de hydrofobe aminozuuren zich in een membraaneiwit?

  De hydrofobe aminozuren van een membraaneiwit zitten voornamelijk in de fosfolipide dubbellaag van de membraan.

• Wat is de functie van een chaparones en noem er 2?

  • Chaparones zorgen ervoor dat er zo min mogelijk verkeerde vouwingen ontstaan
    
  • Hsp70 
  • belangrijkste systeem voor begeleiden van de eiwitvouwing tijdens de translatie
  • Hsp60
  • betrokken bij herstel verkeerd gevouwen eiwitten (achteraf)

• Hoe werken de Hsp70 chaperones?

  • Ze binden aan hydrofobe delen van polypeptides en voorkomen het aan elkaar gaan zitten van de hydrofobe polypeptides 
    
  • gebruiken energie doormiddel van ATP om binding tot stand te brengen en vervolgens als de ATP gehydrolyseerd wordt, dan komt daar energie bij vrij en helpt de vrijgekomen energie bij vouwing van het eiwit. 

• Hoe werken Hsp60 chaperones?

  • Hsp60 chaperon eiwitten helpen verkeerd gevouwen eiwitten om zich weer/alsnog correct te vouwen
    
  • Hsp60 vormt een kamer met een hydrofobe omgeving waarin verkeer gevouwen eiwitten de kans krijgen alsnog de juiste conformatie aan te nemen.